Classificação dos Vírus - Vihrus's Classification
classificação dos vírus - Virus classification
Classificação dos vírus é o processo de nomear vírus e colocando-os em uma taxonómica sistema. Similar aos sistemas de classificação utilizados por organismos celulares , classificação vírus é objecto de debate e as propostas em curso. Isto é principalmente devido ao -vivo pseudo natureza do vírus, o que quer dizer que eles são partículas não-vivos com algumas características químicas semelhantes às da vida, ou acytota . Como tal, eles não se encaixam perfeitamente no estabelecida classificação biológica sistema em vigor para os organismos celulares.
Os vírus são classificados principalmente por fenotípicas características, tais como morfologia , ácido nucleico tipo e modo de replicação, organismos hospedeiros , e do tipo de doença que provocam. A classificação taxonômica formal do vírus é de responsabilidade do Comitê Internacional de Taxonomia de Vírus do sistema (ICTV), embora a classificação de Baltimore sistema pode ser usado para colocar vírus em um dos sete grupos com base no seu modo de síntese de mRNA. Convenções de nomenclatura específicas e novas orientações de classificação são definidas pela ICTV.
Um catálogo de vírus conhecidos todo o mundo tem sido proposto; alguns esforços preliminares relacionadas foram realizadas.
Conteúdo
definição espécies vírus
Espécies formam a base de qualquer sistema de classificação biológica. O ICTV tinha adotado o princípio de que uma espécie de vírus é um politética classe de vírus que constitui uma linhagem de replicação e ocupa um nicho ecológico particular. Em Julho de 2013, a definição de espécies ICTV estado alterado para: "Uma espécie é um grupo de vírus monofiletico cujas propriedades podem ser distinguidas daquelas de outras espécies por vários critérios."
classificação ICTV
O Comitê Internacional de Taxonomia de Vírus começou a conceber e implementar regras para a nomeação e classificação de vírus no início da década de 1970, um esforço que continua até o presente. O ICTV é o único órgão encarregado pela União Internacional de Sociedades microbiológicos com a tarefa de desenvolver, refinar e manter uma taxonomia vírus universal.
O sistema partilha muitas características com o sistema de classificação de organismos celulares, tais como taxon estrutura. No entanto, este sistema de nomenclatura difere de outros códigos taxonômicos em diversos pontos. Um ponto menor é que os nomes de ordens e famílias estão em itálico, ao contrário do Código Internacional de Nomenclatura Botânica e Código Internacional de Nomenclatura Zoológica .
classificação dos vírus começa no nível do reino e continua como se segue, com os sufixos táxon dadas em itálico:
- Reino ( -viria )
Nomes de espécies muitas vezes tomam a forma de vírus [Doenças] , particularmente para plantas superiores e animais. Em novembro de 2018, apenas phylum, subfilo, classe, família, ordem, subordem, família, subfamília, género, e espécies são utilizadas.
O estabelecimento de uma ordem é baseada na inferência de que as famílias de vírus que ele contém muito provavelmente evoluiu de um ancestral comum. A maioria das famílias de vírus permanecem unplaced.
A partir de 2018, apenas um único filo, dois subfilos, seis classes, 14 ordens , cinco subordens, 143 famílias, 64 subfamílias , 846 gêneros e 4.958 espécies de vírus foram definidos pela ICTV. As ordens são as seguintes:
- Caudovirales são atados dsDNA (grupo I) bacteriófagos .
- Herpesvirales contêm grandes eucarióticas vírus dsDNA.
- Ligamenvirales contém linear, dsDNA (grupo I) Arqueanas vírus.
- Mononegavirales incluem não-segmentados - cadeia ssRNA (Grupo V) () de plantas e animais vírus.
- Nidovirales são compostos de cadeia (+) ssRNA (Grupo IV) com vírus de vertebrado hospedeiros.
- Ortervirales conter vírus de ARN e ADN de cadeia simples que se replicam através de um intermediário de ADN (Grupos VI e VII).
- Picornavirales contém pequena (+) strand ssRNA vírus que infectam uma variedade de plantas, insectos e animais hospedeiros.
- Tymovirales conter monopartido (+) vírus de ssRNA que infectam plantas.
- Bunyavirales conter tripartidas (-) Vírus de ssRNA (Grupo V).
Estas ordens abrangem vírus com diferentes gamas de acolhimento. O Ortervirales (Grupos VI e VII), contendo também os retrovírus (animais que infectam os seres humanos, incluindo, por exemplo, HIV ), retrotransposões (infectar invertebrados animais, plantas e eucariotas microorganismos) e caulimoviruses (plantas que infectam), são recentes adições aos pedidos do sistema de classificação.
Outras variações ocorrem entre as ordens: Nidovirales , por exemplo, são isolados para a sua diferenciação em expressar proteínas estruturais e não estruturais separadamente.
classificação de vírus com base na estrutura
Tem sido sugerido que a semelhança na estrutura de montagem e observada para certos grupos virais infectam hospedeiros de diferentes domínios de vida do virião (por exemplo, bacterianas e tectiviruses adenovírus eucarióticas ou procarióticas e os herpesvírus Caudovirales eucarióticas) reflecte uma relação evolutiva entre estes vírus. Portanto, a relação estrutural entre os vírus tem sido sugerido para ser utilizado como uma base para definir taxa de nível superior - linhagens virais baseadas em estrutura - que podia complementar o esquema de classificação ICTV existente.
Classificação de Baltimore (definido pela primeira vez em 1971) é um sistema de classificação que coloca os vírus em um de sete grupos de acordo com uma combinação da sua ácido nucleico ( ADN ou ARN ), TIPO DE CADEIA (de cadeia simples ou de cadeia dupla), Senso , e método de replicação . Nomeado após David Baltimore , um Prêmio Nobel -winning biólogo, esses grupos são designados por algarismos romanos . Outras classificações são determinadas pela doença causada pelo vírus ou a sua morfologia, nenhum dos quais são satisfatórios devido a diferentes vírus, quer fazendo com que a mesma doença ou à procura muito semelhante. Além disso, estruturas virais são muitas vezes difíceis de determinar sob o microscópio. Classificar os vírus de acordo com o seu genoma significa que aqueles em uma determinada categoria serão todos se comportam de forma semelhante, oferecendo alguma indicação de como proceder com novas pesquisas. Os vírus podem ser colocados em um dos sete grupos seguintes:
- I: vírus dsDNA (por exemplo, Adenovírus , vírus do herpes , poxvírus )
- II: vírus de ADNcs (cadeia + ou "sentido") de ADN (por exemplo Parvoviruses )
- III: vírus de dsRNA (por exemplo reovirus )
- IV: vírus (+) ssRNA (+ cadeia ou sentido) ARN (por exemplo, picornavírus , Togavus )
- V: (-) vírus de ssRNA (- cadeia ou anti-sentido) de ARN (por exemplo, ortomixovus , Rabdovírus )
- VI: vírus ssRNA-RT (cadeia + ou ARN de sentido) com ADN intermediário no ciclo de vida (por exemplo, Retrovírus )
- VII: ADNcd-RT vírus de ADN com ARN intermediio do ciclo de vida (por exemplo, Hepadnaviruses )
vírus de DNA
- Grupo I : vírus possuem ADN de cadeia dupla. Os vírus que causam a varicela e herpes são encontrados aqui.
- Grupo II : vírus possuem ADN de cadeia simples.
| família de vírus | Exemplos (nomes comuns) | Virião nu / envolto | capsídeo simetria | Tipo de ácido nucleico | Grupo |
|---|---|---|---|---|---|
| 1. Adenoviridae | Adenovírus, infecciosa canina vírus da hepatite | Nu | icosaédrico | ds | Eu |
| 2. Papovaviridae | Papillomavirus , Polyomaviridae , vírus vacuolating símia | Nu | icosaédrico | ds circular | Eu |
| 3. Parvoviridae | Parvovírus B19, parvovírus canino | Nu | icosaédrico | ss | II |
| 4. Herpesviridae | Vírus do herpes simplex , vírus varicela-zoster , citomegalovírus , vírus Epstein-Barr | Envelope | icosaédrico | ds | Eu |
| 5. Poxviridae | Vírus da varíola , o vírus da varíola vaca, vírus varíola ovina, vírus orf, vírus da varíola símia, vírus vaccinia | casacos complexos | Complexo | ds | Eu |
| 6. Hepadnaviridae | O vírus da hepatite B | Envelope | icosaédrico | circulares, parcialmente ds | VII |
| 7. Anelloviridae | vírus teno Torque | Nu | icosaédrico | ss circular | II |
vírus de ARN
- Grupo III : vírus possuem genomas de ARN de cadeia dupla, por exemplo, rotavírus .
- Grupo IV : vírus possuem de sentido positivo genomas de ARN de cadeia simples. Muitos vírus bem conhecidos encontram-se neste grupo, incluindo os picornavírus (que é uma família de vírus que inclui vírus conhecidos, como vírus da hepatite A, enterovus, rinovus, poliovus, e vírus da febre aftosa), SARS vírus, hepatite C vírus, febre amarela vírus, e rubéola vírus.
- Grupo V : vírus possuem de sentido negativo genomas de ARN de cadeia simples. Os mortais Ebola e vírus de Marburg são bem conhecidos membros deste grupo, juntamente com o vírus da gripe , sarampo , caxumba e raiva .
Reverter vírus transcrever
- Grupo VI : vírus possuem vírus de ARN de cadeia simples que se replicam através de um intermediário de ADN. Os retrovírus são incluídos nesse grupo, de que o HIV é um membro.
- Grupo VII : vírus possuem genomas de cadeia dupla de ADN e replicar utilizando transcriptase reversa . A hepatite B vírus podem ser encontrados neste grupo.
classificação Holmes
Holmes (1948) utilizado Carl Linnaeus sistema 's de nomenclatura binária para classificar vírus em 3 grupos, sob uma ordem, virales . Eles são colocados como se segue:
- Grupo I: Phaginae (ataques bactérias)
- Grupo II: Phytophaginae (ataques de plantas)
- Grupo III: Zoophaginae (ataques de animais)
Sistema LHT de classificação dos vírus
O Sistema de Classificação LHT vírus baseia caracteres químicos e físicos, como o ácido nucleico (ADN ou ARN), a simetria (helicoidais ou icosaédrica ou complexo), presença de envelope, o diâmetro do capsídeo , número de capsómeros . Esta classificação foi aprovado pelo Comité de Provisória sobre Nomenclatura de Vírus (PNVC) da Associação Internacional de Sociedades microbiológicos (1962). É como segue:
- Filo Vira (dividida em 2 subfilos)
- Subfilo Deoxyvira (vírus de ADN)
- Classe Deoxybinala (dupla simetria)
- fim Urovirales
-
- Phagoviridae família
- Classe Deoxyhelica (simetria helicoidal)
- fim Chitovirales
-
- Poxviridae família
- Classe Deoxycubica (simetria cúbica)
- fim Peplovirales
-
- Família Herpesviridae (162 capsômeros)
- Fim Haplovirales (sem envelope)
-
- Família Iridoviridae (812 capsômeros)
- Família Adenoviridae (252 capseros)
- Família Papiloviridae (72 capsômeros)
- Família Paroviridae (32 capsômeros)
- Família Microviridae (12 capsômeros)
- Subfilo Ribovira (vus de ARN)
- classe Ribocubica
- fim Togovirales
-
- Arboviridae família
- fim tymovirales
-
- Napoviridae família
- Reoviridae família
- classe Ribohelica
- fim Sagovirales
-
- Stomataviridae família
- Paramyxoviridae família
- Myxoviridae família
- fim Rhabdovirales
- subordem Flexiviridales
- Mesoviridae família
- Peptoviridae família
- subordem Rigidovirales
- Pachyviridae família
- Protoviridae família
- Polichoviridae família
agentes sub-virais
Os agentes seguintes são menores do que os vírus, mas têm apenas algumas de suas propriedades.
viróides
- família Avsunviroidae
- Genus Avsunviroid ; escreva espécies : abacate sunblotch viróide
- Genus Pelamoviroid ; espécies de tipo: pêssego viróide mosaico latente
- Genus Elaviroid ; escreva espécies: viróide latente beringela
- família Pospiviroidae
- Genus Pospiviroid ; espécies de tipo: viróide batata tubérculo fuso
- Genus Hostuviroid ; escreva espécies: Hop viróide duplos
- Genus Cocadviroid ; digite espécies: viroid coco Cadang-Cadang
- Genus Apscaviroid ; digite espécies: viroid pele cicatriz da Apple
- Genus Coleviroid ; escreva espécies: Coleus blumei viróide 1
satélites
Satélites dependem de co-infecção de uma célula hospedeira com um vírus auxiliar para a multiplicação produtivo. Seus ácidos nucleicos têm sequências de nucleótidos substancialmente distintas a partir de qualquer vírus auxiliar ou a sua hospedeira. Quando um agente subviral satélite codifica a proteína de revestimento em que é encapsulado, isto é, em seguida, chamado um vírus satélite.
- vírus satélite
- os vírus de cadeia simples de ARN satélite
- Subgrupo 1: vírus satélite crônica abelha-paralisia
- Subgrupo 2: Tobacco necrose vírus satélite
- Vírus de cadeia dupla de DNA satélite ( virophages )
- os vírus de cadeia simples de ARN satélite
- Os ácidos nucleicos de satélite
- DNAs de fita simples de satélite
- RNAs de cadeia dupla de satélite
- RNAs de cadeia única de satélite
- Subgrupo 1: Grandes RNAs satélites
- Subgrupo 2: RNAs satélites lineares Pequenas
- Subgrupo 3: RNAs satélites circulares ( virusóides )
prions
Os priões , nomeado para a sua descrição como " pr oteinaceous e em partículas infecciosos", carecem de qualquer detectável (a partir de 2002) ácidos nucleicos ou partículas semelhantes a vírus. Eles resistem procedimentos de inactivao que normalmente afectam os ácidos nucleicos.
- priões de mamífero:
- Agentes de encefalopatias espongiformes
- Priões fúngicas :
- PSI + prião de Saccharomyces cerevisiae
- Prion URE3 de Saccharomyces cerevisiae
- RnQ / PIN + prião de Saccharomyces cerevisiae
- Het-s prião de Podospora anserina
partículas interferentes defeituosas
- ARN interferentes deficientes
- DNA interferindo com defeito
Veja também
Notas
- ^ Zimmer, Carl (5 de Setembro de 2013). "Um catálogo para todos os vírus do mundo?" . New York Times . Retirado 6 de Setembro de 2013 .
- ^ Witzany L (ed) (2012). Vírus: agentes essenciais da vida. Springer. ISBN 978-94-007-4898-9 .
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